U okviru vakcinacije i prevencije putničkih bolesti sprovode se neobavezna cijepljenja odraslih osoba i djece, uz izdavanje potvrde o vakcinaciji. Dostupne su vakcine protiv:
- difterije – tetanusa;
- gripe (sezonske);
- hepatitisa A;
- hepatitisa B;
- HPV-a;
- kolere;
- krpeljnog meningoencefalitisa;
- meningoencefalitisa ACWY135;
- ospica;
- pneumokokne bolesti;
- rubeole;
- tetanusa;
- trbušnog tifusa;
- vodenih kozica;
- zaušnjaka;
- žute groznice.
Obavezna vakcinacija putnika:
- žuta groznica;
- meningokokni meningitis.
U okviru preventivne zaštite zavod također pruža usluge antirabične zaštite (zaštita od bjesnila) gdje se obrađuju pacijenti ugroženi od toplokrvnih životinja (uz prisustvo epidemiologa).